Las lesiones más frecuentes en la zona periapical son granuloma, absceso alveolar y quiste radicular. Son reacciones inflamatorias a la irritación causada por bacterias y sus productos, que se extienden desde la pulpa atacada al ligamento periodontal, y después se propagan al hueso alveolar adyacente. Menos a menudo, las enfermedades periapicales resultan de traumatismo dentario, fármacos usados en el tratamiento de la pulpa o extensión de un proceso infeccioso gingival.
La lesión periapical más frecuente es el granuloma, Es una masa proliferantes de tejido inflamatorio crónico, que consiste en vasos sanguíneos neoformados, tejido conectivo en proliferación con predominio de células plasmáticas junto con linfocitos, histiocitos y leucocitos polimorfonucleares. El granuloma está considerado como una lesión benigna; suele ser asintomático a menos que experimente inflamación aguda, y pasa inadvertido hasta que se descubre al efectuar radiografía. El granuloma puede transformarse en quiste radicular. Otras modificaciones posibles son necrosis central con supuración y formación de absceso o calcificación patológica focal.